Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SV2AQ7L0J3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms