Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smpd4Q6ZPR5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms