Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atp8b3Q6UQ17 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8b3Q6UQ17 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms