Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc9c1Q6UJY2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms