Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300ld3Q6SJQ5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms