Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3ipQ68EF0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3ipQ68EF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms