Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3bQ62141 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sin3bQ62141 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms