Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lama5Q61001 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lama5Q61001 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Lama5Q61001 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lama5Q61001 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms