Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim38Q5SZ99 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms