Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znrf3Q5SSZ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znrf3Q5SSZ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms