Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdh12Q5RJH3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdh12Q5RJH3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms