Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmtc2Q56A06 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmtc2Q56A06 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms