Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2al1nQ497L1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms