Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
4933416C03RikQ3V063 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4933416C03RikQ3V063 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms