Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shisa3Q3UPR0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa3Q3UPR0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa3Q3UPR0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Shisa3Q3UPR0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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