Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp13a5Q3TYU2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp13a5Q3TYU2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms