Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spatc1Q148B6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spatc1Q148B6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spatc1Q148B6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spatc1Q148B6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spatc1Q148B6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Spatc1Q148B6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Spatc1Q148B6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Spatc1Q148B6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spatc1Q148B6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spatc1Q148B6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spatc1Q148B6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Spatc1Q148B6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spatc1Q148B6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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