Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnn1Q08091 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnn1Q08091 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms