Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CkbQ04447 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CkbQ04447 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CkbQ04447 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CkbQ04447 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CkbQ04447 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms