Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC6A3Q01959 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC6A3Q01959 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms