Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb2Q00977 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb2Q00977 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms