Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SbdsP70122 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms