Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Copz1P61924 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copz1P61924 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms