Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa8P50706 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa8P50706 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms