Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx3P48759 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx3P48759 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms