Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sipa1P46062 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sipa1P46062 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms