Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms