Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PpargP37238 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpargP37238 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpargP37238 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpargP37238 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PpargP37238 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PpargP37238 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PpargP37238 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PpargP37238 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PpargP37238 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpargP37238 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpargP37238 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PpargP37238 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms