Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rab18P35293 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rab18P35293 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Rab18P35293 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab18P35293 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab18P35293 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab18P35293 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab18P35293 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab18P35293 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rab18P35293 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rab18P35293 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab18P35293 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rab18P35293 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab18P35293 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms