Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rab5cP35278 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab5cP35278 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rab5cP35278 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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