Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoc1P34928 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoc1P34928 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms