Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ctnna1P26231 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ctnna1P26231 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms