Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cbx3P23198 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx3P23198 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms