Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vpreb1P13372 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vpreb1P13372 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms