Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-Eb1P04230 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-Eb1P04230 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms