Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATG12O94817 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG12O94817 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG12O94817 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG12O94817 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATG12O94817 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG12O94817 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG12O94817 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG12O94817 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms