Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F11rO88792 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F11rO88792 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F11rO88792 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
F11rO88792 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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F11rO88792 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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F11rO88792 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
F11rO88792 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
F11rO88792 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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