Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf5O70191 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf5O70191 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atf5O70191 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms