Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms