Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MsmbO08540 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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