Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm4791J3QQ14 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Gm4791J3QQ14 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm4791J3QQ14 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Gm4791J3QQ14 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm4791J3QQ14 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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