Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer2J3QPU5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer2J3QPU5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer2J3QPU5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms