Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm20795J3QP49 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms