Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sptbn5F6UCX4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn5F6UCX4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn5F6UCX4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms