Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lmod3E9QA62 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmod3E9QA62 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms