Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm11127A7VMS2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11127A7VMS2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11127A7VMS2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11127A7VMS2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11127A7VMS2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm11127A7VMS2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm11127A7VMS2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm11127A7VMS2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm11127A7VMS2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm11127A7VMS2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm11127A7VMS2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Gm11127A7VMS2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Gm11127A7VMS2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm11127A7VMS2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm11127A7VMS2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm11127A7VMS2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm11127A7VMS2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm11127A7VMS2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11127A7VMS2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm11127A7VMS2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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