Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
H2al1jA2BFR3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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