Protein–RNA interactions for Protein: A2AP83

Fnd3c2, Fibronectin type III domain-containing 3C2, mousemouse

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnd3c2A2AP83 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fnd3c2A2AP83 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fnd3c2A2AP83 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms