Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxd9P28357 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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