Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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Ccdc18Q640L5 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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Ccdc18Q640L5 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccdc18Q640L5 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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